Acho que no momento do acidente,eles cairam e foram trasportados de alguma forma.Não foi o Desmond que derrubou o Avião.
Eles foram para o futuro,um lugar onde começou-se a surgir um tipo de civilizacão de apenas 4 DEDOS NO PÉ.
Agora existe os Outros,que são os sobreviventes e querem continuar alguma experiencia,e para isso,usam as base e Laboratorios da Dharma Infinitive.
Pode estar um pouco certa,poder estar errada,mas esta é mais uma teoria...